Junoy, J. 1987. Primera cita de Alkmaria romijni, Horst 1919 (Polychaeta, Ampharetidae) en las costas ibéricas. Miscelania Zoologica 11: 87-91.
Junoy J, Viéitez JM. 1990. Manayunkia aestuarina (Bourne, 1883) (Polychaeta, Sabellidae), en la Ría de Foz (Galicia, España). Boletín de la Real Sociedad Española de Historia Natural (Sección Biológica) 86 : 83-94.
Junoy, J. y Viéitez, J. M. 1992. Biogeografía de las especies Ibéricas de Spionidae (Annelida, Polychaeta). Actas V Simposio Ibérico de Estudios del Bentos Marino 2: 115-147.
Junoy J., Junoy J. 2014. First record of the buoy barnacle Dosima fascicularis (Ellis & Solander, 1786) (Crustacea, Cirripedia) from the Galician beaches (NW spain) after the Prestige oil spill. Check List 10 (3): 669-671.
Junoy J. 2015. Proteger la biodiversidad, pero… Verd 80: 20-21.
Big Van. 2016. Si venimos del mono ¿por qué somos tan cerdos?. La Esfera de los Libros. Madrid, 326 p
Moreira J, Junoy J. 2017. First record of the genus Paranebalia Claus, 1880 (Crustacea: Leptostraca) from the Mediterranean Sea. Mediterranean Marine Science 18: 332-339.
Junoy, J. 2019 (Ed.) Especies exóticas invasoras. Cátedra Parques Nacionales. Universidad de Alcalá, Servicio de Publicaciones. Monografias Ciencias 6, 277 pp.
Junoy, J. 2019. Especies exóticas invasoras y Parques Nacionales: síntesis de una mesa redonda. En: Especies exóticas invasoras. Cátedra Parques Nacionales. Junoy, j (Ed.) Universidad de Alcalá, Servicio de Publicaciones. Monografias Ciencias 6: 275-277.
Taboada, S., Silva A.S., Díez-Vives, C., Neal, L., Cristobo, J., Ríos, P., Hestetun J.T., Clark , B., Rossi M.L., Junoy, J., Navarro, J., Riesgo, A. 2020.Sleeping with the enemy: unravelling the symbiotic relationships between the scale worm Neopolynoe chondrocladiae (Annelida: Polynoidae) and its carnivorous sponge hosts. Zoological Journal of the Linnean Society, 2020, XX, 1–24
Junoy, J. 2021. ¿Pero qué le hemos hecho a la Naturaleza para que nos haga esto? En COVID-19 Un enfoque plural. De la Mata FJ, Sánchez-Prieto Borja P, Senra Díaz E, Such Devesa MJ (Eds). Editorial Universidad de Alcalá. 39-53 pp.
Junoy, J. 2021. Los bichos y los virus. En: El murciélago que la lio parda. Apocalipsis Covid-19 y otros virus. Big Van Ciencia (Ed.).La Esfera de los Libros: 175-196.
Junoy, J. 2021. Manual de autoextinción para imbéciles. En: El murciélago que la lio parda. Apocalipsis Covid-19 y otros virus. Big Van Ciencia (Ed.).La Esfera de los Libros: 217-220.
