Junoy, J. 1987. Primera cita de Alkmaria romijni, Horst 1919 (Polychaeta, Ampharetidae) en las costas ibéricas. Miscelania Zoologica 11: 87-91.
Junoy J, Viéitez JM. 1990. Manayunkia aestuarina (Bourne, 1883) (Polychaeta, Sabellidae), en la Ría de Foz (Galicia, España). Boletín de la Real Sociedad Española de Historia Natural (Sección Biológica) 86 : 83-94.
Junoy, J. y Viéitez, J. M. 1992. Biogeografía de las especies Ibéricas de Spionidae (Annelida, Polychaeta). Actas V Simposio Ibérico de Estudios del Bentos Marino 2: 115-147.
Junoy J., Junoy J. 2014. First record of the buoy barnacle Dosima fascicularis (Ellis & Solander, 1786) (Crustacea, Cirripedia) from the Galician beaches (NW spain) after the Prestige oil spill. Check List 10 (3): 669-671.
Junoy J. 2015. Proteger la biodiversidad, pero… Verd 80: 20-21.
Big Van. 2016. Si venimos del mono ¿por qué somos tan cerdos?. La Esfera de los Libros. Madrid, 326 p
Moreira J, Junoy J. 2017. First record of the genus Paranebalia Claus, 1880 (Crustacea: Leptostraca) from the Mediterranean Sea. Mediterranean Marine Science 18: 332-339.
Junoy, J. 2019 (Ed.) Especies exóticas invasoras. Cátedra Parques Nacionales. Universidad de Alcalá, Servicio de Publicaciones. Monografias Ciencias 6, 277 pp.
Junoy, J. 2019. Especies exóticas invasoras y Parques Nacionales: síntesis de una mesa redonda. En: Especies exóticas invasoras. Cátedra Parques Nacionales. Junoy, j (Ed.) Universidad de Alcalá, Servicio de Publicaciones. Monografias Ciencias 6: 275-277.
Taboada, S., Silva A.S., Díez-Vives, C., Neal, L., Cristobo, J., Ríos, P., Hestetun J.T., Clark , B., Rossi M.L., Junoy, J., Navarro, J., Riesgo, A. 2020.Sleeping with the enemy: unravelling the symbiotic relationships between the scale worm Neopolynoe chondrocladiae (Annelida: Polynoidae) and its carnivorous sponge hosts. Zoological Journal of the Linnean Society, 2020, XX, 1–24
Junoy, J. 2021. ¿Pero qué le hemos hecho a la Naturaleza para que nos haga esto? En COVID-19 Un enfoque plural. De la Mata FJ, Sánchez-Prieto Borja P, Senra Díaz E, Such Devesa MJ (Eds). Editorial Universidad de Alcalá. 39-53 pp.
Junoy, J. 2021. Los bichos y los virus. En: El murciélago que la lio parda. Apocalipsis Covid-19 y otros virus. Big Van Ciencia (Ed.).La Esfera de los Libros: 175-196.
Junoy, J. 2021. Manual de autoextinción para imbéciles. En: El murciélago que la lio parda. Apocalipsis Covid-19 y otros virus. Big Van Ciencia (Ed.).La Esfera de los Libros: 217-220.
Junoy, J. 2023. El fraude de las zamburiñas. The Conversation 7 diciembre 2023
Junoy, J. 2023. El sueño de un vegano: el árbol del que nacen los gansos. The Conversation 19 diciembre 2023
Junoy, J.2023.Inocentadas ¡bestiales! The Conversation 27 diciembre 2023
Junoy, J. 2024.El top 10 de las nuevas especies marinas, cuyo número no deja de crecer. The Conversation. 4 abril 2024
Junoy, J. 2024. La Luna, la playa y la picadura del pez araña. The Conversation 10 julio 2024
Frutos, I. Junoy, J. 2025. Descubriendo los diminutos seres que habitan los fondos oceánicos. The Conversation 8 junio 2025
